Торжественное открытие Сибирской школы № 2 состоялось 11 ноября 1991 года.
С 1991 года по 1999 год школа имела статус «Сибирская школа-колледж» с фермерским уклоном.
C 1999 года до 2001 года — «Сибирская средняя общеобразовательная школа №2».
С 2001 года — Муниципальное образовательное учреждение «Сибирская СОШ №2». (МОУ «Сибирская СОШ №2»)
С 2012 года — Муниципальное казенное образовательное учреждение «Сибирская средняя общеобразовательная школа №2 Омского муниципального района Омской области». (МКОУ «Сибирская СОШ №2»)
С 2015 года — Муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение «Сибирская средняя общеобразовательная школа №2 Омского муниципального района Омской области». (МБОУ «Сибирская СОШ №2»)